Karl Jäger commande l'Einsatzkommando 3, qui appartient à l'Einsatzgruppe A. Cette unité des Einsatzgruppen, composée principalement de SS, est chargée de détruire le « judéo-bolchevisme » dans l'ensemble de la Lituanie.
« Kaunas, le 1er décembre 1941 […]
Le commando EK3 est entré en action le 2 juillet 1941 […]. Nos hommes ont procédé aux opérations citées ci-dessous en collaboration avec les patriotes lituaniens :
7.7.41 Mariampole : Juifs 32 […]
1.8.41 Ukmerge : 254 Juifs, 42 Juives, 1 comm[issaire] pol[itique], 2 agents lit[uaniens]. Du NKVD, 1 maire de Jonova […]
15 et 16.8.41 Rokiskis : 3 200 Juifs, Juives et enfants j[uifs] […]
Total : 137 346
Aujourd'hui, il m'est possible d'affirmer que le EK3 a atteint l'objectif fixé, il a résolu le problème juif en Lituanie. […]
La réalisation de ce type d'opérations a été avant tout un problème d'organisation. Toute décision visant à nettoyer un district de ces Juifs exigeait que chaque opération fut soigneusement préparée, que l'on tâtât le terrain dans le district concerné. Il a fallu rassembler les Juifs à un ou plusieurs endroits, puis, au vu du nombre, chercher un lieu adéquat pour creuser les fosses nécessaires. La distance à parcourir entre les lieux de rassemblements et les fosses était en moyenne de 4 à 5 km. Les Juifs ont été répartis en colonnes de 500 et acheminés vers les lieux d'exécution à intervalles d'au moins 2 km Un exemple pris au hasard montrera à quel point ce travail a été difficile et éprouvant pour les nerfs.
A Rokiskis, il a fallu acheminer 3 208 personnes sur une distance de 4,5 km avant de pouvoir procéder à la liquidation. Pour venir à bout de cette tâche en l'espace de 24 heures, 60 des 80 patriotes lituaniens disponibles ont dû participer ou aider au transport, en l'occurrence, à interdire l'accès au secteur. Les hommes restant que l'on a été sans cesse obligé de relever ont abattu tout le travail avec mes hommes. Nous disposons rarement de véhicules pour ces transports.
Extrait du rapport rédigé le 1er décembre 1941 par le SS Karl Jäger, commendant de l'Einsatzkommando 3 de l'Einsatzgruppe A